Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Hpf1Q8CFE2 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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Hpf1Q8CFE2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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