Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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