Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ttc21aQ8C0S4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ttc21aQ8C0S4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ttc21aQ8C0S4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ttc21aQ8C0S4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ttc21aQ8C0S4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ttc21aQ8C0S4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Ttc21aQ8C0S4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Ttc21aQ8C0S4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Ttc21aQ8C0S4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Ttc21aQ8C0S4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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