Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg4bQ8BGE6 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms