Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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IfneQ80ZF2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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IfneQ80ZF2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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IfneQ80ZF2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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IfneQ80ZF2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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IfneQ80ZF2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IfneQ80ZF2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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