Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Clec18aQ7TSQ1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Clec18aQ7TSQ1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Clec18aQ7TSQ1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Clec18aQ7TSQ1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Clec18aQ7TSQ1 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Clec18aQ7TSQ1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Clec18aQ7TSQ1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Clec18aQ7TSQ1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Clec18aQ7TSQ1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Clec18aQ7TSQ1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms