Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms