Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC061212Q6P8K3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms