Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms