Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm2bQ6P1G2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms