Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt39Q6IFX4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Krt39Q6IFX4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Krt39Q6IFX4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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