Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

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Length 1,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Fndc3c1Q6DFV6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Fndc3c1Q6DFV6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Fndc3c1Q6DFV6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fndc3c1Q6DFV6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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