Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim25Q61510 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim25Q61510 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim25Q61510 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim25Q61510 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim25Q61510 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim25Q61510 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim25Q61510 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms