Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r223Q5SSA0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r223Q5SSA0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r223Q5SSA0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r223Q5SSA0 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r223Q5SSA0 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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