Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Fam220aQ3ZN08 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Fam220aQ3ZN08 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Fam220aQ3ZN08 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Fam220aQ3ZN08 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Fam220aQ3ZN08 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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