Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms