Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms