Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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