Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Q3U1D9 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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