Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms