Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rpusd3Q14AI6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rpusd3Q14AI6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rpusd3Q14AI6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rpusd3Q14AI6 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rpusd3Q14AI6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rpusd3Q14AI6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rpusd3Q14AI6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rpusd3Q14AI6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rpusd3Q14AI6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rpusd3Q14AI6 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rpusd3Q14AI6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rpusd3Q14AI6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rpusd3Q14AI6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms