Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms