Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms