Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms