Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1sQ02789 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms