Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms