Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms