Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms