Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms