Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smn1P97801 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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