Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcc1P97496 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms