Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrig1P70193 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms