Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp2P63044 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms