Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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