Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps13P62301 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps13P62301 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms