Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P58686 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P58686 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P58686 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P58686 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P58686 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P58686 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P58686 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P58686 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P58686 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P58686 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P58686 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P58686 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P58686 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P58686 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P58686 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P58686 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P58686 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms