Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms