Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms