Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp25P57080 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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