Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Irf5P56477 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Irf5P56477 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Irf5P56477 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Irf5P56477 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Irf5P56477 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Irf5P56477 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Irf5P56477 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Irf5P56477 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Irf5P56477 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Irf5P56477 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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