Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FmodP50608 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
FmodP50608 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
FmodP50608 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
FmodP50608 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
FmodP50608 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
FmodP50608 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
FmodP50608 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
FmodP50608 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms