Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms