Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtbP41155 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms