Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lig1P37913 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms