Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms