Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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