Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtsdP18242 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CtsdP18242 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CtsdP18242 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms