Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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