Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
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BckdkO55028 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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BckdkO55028 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
BckdkO55028 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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BckdkO55028 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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BckdkO55028 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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BckdkO55028 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
BckdkO55028 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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BckdkO55028 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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BckdkO55028 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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BckdkO55028 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BckdkO55028 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BckdkO55028 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BckdkO55028 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 542.9 ms