Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms